Ozon bakterileri, virüsleri, sporları, küfleri ve algleri öldüren etkili bir dezenfektandır.

ozon klor ile karşılaştırılır:
Klor gazı gibi yüksek konsantrasyonlu ozon da zehirli bir gazdır.
Klor gazının aksine ozon, suya koyduğunuzda yerinde durmaz, 25 derece c (77 f) havuz suyu sıcaklığında 30 dakika içinde oksijene dönüşür ve daha yüksek sıcaklıkta daha hızlıdır.
Klor gazının aksine ozon arıtma suyu kokusuzdur, yan ürün üretmez, cildi kurutmaz veya gözleri tahriş etmez, saçları veya mayoları ağartmaz.
Ozon ayrıca suyun pH dengesine dokunmaz ve havuz kaplaması için klor kullanımına göre çok daha az aşındırıcıdır.
Yüzme havuzlarında bulunan klor yan ürünleri (kloroform bromodiklorometan kloral hidrat dikloroasetonitril ve tri-halo metanlar), ABD'de yürütülen güvenilir araştırmalara göre daha yüksek astım akciğer hasarı, ölü doğum, düşük ve mesane kanseri vakalarıyla bağlantılıdır.

ve birçok çalışma, ozon jeneratörünün havuzu etkili bir şekilde temizleyebildiğini ve suyu küf bakterisi, maya ve mantarlardan arındırdığını göstermiştir.
Son olarak havuz ozon jeneratörü kullanmak aynı zamanda havuzun temiz tutulmasına ilişkin genel bakım maliyetlerinin azaltılmasına da yardımcı olur.
Ozonatörün maliyeti satın alınacak boyuta ve modele göre değişiklik gösterebilir.
Ancak havuz sahipleri, mikroskobik organizmalar için havuz ozon jeneratörünün kullanıldığını unutmamalıdır.